Schnorchel : tube hissable, permettant à un sous-marin d’alimenter en air ses moteurs diesel en faible immersion.
Sextant : .Instrument muni d'un secteur gradué de 60° (sixième partie de la circonférence), qui permet de mesurer la hauteur des astres , malgré l'instabilité de l'observateur, pour déterminer la position du bateau.
Sillage : trace que fait un bâtiment lorsqu’il navigue
Sister-ships : bateaux construits selon les mêmes plans et de caractéristiques identiques.
SNA : Sous-marin nucléaire d'attaque.
SNLE : Sous-marin nucléaire lanceur d'engins.
Sondeur : Ces appareils à ultrasons enregistrent constamment la profondeur de l’eau en mesurant automatique le temps que met une onde sonore à se réfléchir. C’est aussi la profondeur indiquée sur une carte marine .
Souillarde (La) : Surnom donné à bord dans les offices ou caféterias au bac à plonge. ("être de souillarde" = "faire la vaisselle").
Souquer : tirer ou serrer fortement une amarre, un nœud, les tours de cordage qui lient ensemble plusieurs objets , ou souquer sur les avirons , tirer sur les avirons pour accélérer.
Soute : réduit ménagé dans les étages inférieurs d’un navire et qui sert de magasin.
Sur le bord ! : Commandement prononcé pour rendre les honneurs à un officier franchissant la coupée du bâtiment.
Surface : Les forces de la flotte de surface / pour les distinguer des forces sous-marines – la sous-marinade- et de l'aéronautique navale -l'aéro.